De maagklachten bij zweerziekte bestaan vooral uit pijn in de bovenbuik die afneemt bij het nuttigen van een maaltijd of bij gebruik van een zuurremmend middel. Bij maagklachten van dit type zal de arts vaak in eerste instantie een zuursecretieremmend geneesmiddel voorschrijven, vaak een H2-receptorblokker. Wanneer de maagpijn inderdaad op een zweer berust, zal de pijn binnen enkele dagen minder worden. Het is echter niet zeker dat iemand met zweerachtige pijn ook werkelijk een zweer in de darm of maag heeft. Het is echter goed te verdedigen dat in de meeste gevallen eerst een proefbehandeling met een H2-blokker of een protonpompremmer wordt gegeven. Wanneer een maagzweer of twaalfvingerige-darmzweer werkelijk is aangetoond, is de aangewezen behandelstrategie een andere. In dat geval zal moeten worden vastgesteld of er een Helicobacter pylori-infectie bestaat en als dit het geval is, zal deze moeten worden behandeld.