Het rendement van beeldvormend onderzoek is bij maagklachten relatief gering. In een groot gastroscopisch onderzoek bij 3.667 patiënten met ernstige maagklachten werd slechts bij 2% van de patiënten een kwaadaardige tumor van maag of slokdarm gevonden. Bij 19,9% was zweerziekte de oorzaak, bij 23,9% refluxziekte, bij 20,6% maagslijmvliesontsteking en bij 33,6% werden geen afwijkingen gevonden.

Overigens is het heel goed mogelijk dat laatstgenoemde patiënten wel degelijk tijdens het onderzoek refluxziekte (zonder oesofagitis), een maagmotoriekstoornis of een overgevoelige maag hadden. Een 'negatief' beeldvormend onderzoek sluit deze oorzaken absoluut niet uit. Wanneer dit onderzoek geen afwijkingen aan het licht brengt, kan men nog verschillende kanten op. Men kan in de aanwezigheid van klachten berusten in de wetenschap dat er geen gevaarlijke ziektes aanwezig zijn. Men kan er ook voor kiezen om verder onderzoek te laten verrichten (bijvoorbeeld een 24-uurs pH-meting of maagontledigingsonderzoek). Een derde mogelijkheid is om door middel van verdere proefbehandelingen met zuurremmers of prokinetica uit te zoeken of de klacht beïnvloedbaar is. Verwijzing naar een psycholoog of psychiater vindt meestal pas plaats als alles gefaald heeft, of als vanaf het begin af aan aannemelijk is dat psychische factoren een belangrijke rol spelen.