Bij sommige darmziekten is de opname van calcium uit het voedsel in meerdere of mindere mate verstoord. Ook de opname van andere bouwstoffen, zoals eiwitten, kan verminderd zijn.
Dat geldt vooral voor darmaandoeningen die met langdurige diarree of stoornissen in de vertering van het voedsel (malabsorptie) gepaard gaan. Daardoor kunnen langer bestaande darmstoornissen bijdragen tot het ontstaan van osteoporose.
Maagziekten op zich veroorzaken geen osteoporose. Maar indien er een maagoperatie heeft plaatsgevonden waarbij het grootste deel van de maag is weggenomen (maagresectie), is de kans op osteoporose wel toegenomen, omdat hierna de opname van vitamine D verstoord kan raken.